Kenne mich mit den Besonderheiten des G6 nicht aus. Aber kann mir vorstellen, dass xDrip die Kalibrierung ignoriert, weil das bei derart großen Abweichungen keinen Sinn macht. So einen Sensor müsste man eigentlich als defekt bezeichnen.
Aber die großen Abweichungen sind am ersten Tag beim Verlängerung des Dexcom offenbar normal, liest man hier öfter. Beim Neustart wird irgendwie ein Wundheilungseffekt reingerechnet, der beim Verlängern aber nicht da ist. Ich würde deshalb erstmal gar nicht kalibrieren und abwarten, bis sich der Sensor wieder gefangen hat.