Danke euch, ist also doch einfacher als gedacht.
Edit:
Ok, hat alles funktioniert. Habe die prefs gesichert, dann AAPS neu erstellt (dieses mal den Schlüssel der Signatur gesichert), dann die alte 2.0 Version gelöscht, die neue installiert, Einstellungen importiert und voila, es funktioniert alles.